CircRNA測(cè)序

什么是CircRNA？

CircRNA（Circular RNA），是一類不具有 5' 末端帽子和 3' 末端 poly（A）尾巴、并以共價(jià)鍵形成穩(wěn)定閉合環(huán)狀結(jié)構(gòu)的非編碼 RNA 分子。 CircRNA 廣泛存在于生物細(xì)胞中，對(duì) miRNA 起重要的調(diào)控作用，進(jìn)而調(diào)控基因表達(dá)。隨著高通量測(cè)序技術(shù)的發(fā)展， CircRNA 在多種真核生物體內(nèi)被大量鑒定出來，利用高通量測(cè)序技術(shù)，對(duì)生物樣本中的CircRNA 進(jìn)行鑒定、表達(dá)豐度檢測(cè)及結(jié)構(gòu)分析，是 RNA 領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)，推動(dòng)更深入的基因表達(dá)研究。

CircRNA 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)思路為差異比較，常見的類型為實(shí)驗(yàn)組與對(duì)照組（case VS control），進(jìn)行兩兩比較；若考慮時(shí)空因素，如按照不同生長發(fā)育階段或者疾病發(fā)生發(fā)展整個(gè)過程進(jìn)行比較，即進(jìn)行多重比較分析，然后對(duì)差異的CircRNA 來源基因進(jìn)行預(yù)測(cè)和富集分析。一組樣品建議至少 6 個(gè)生物學(xué)重復(fù)。

技術(shù)路線

樣本要求

CircRNA測(cè)序分析項(xiàng)目-飛凡檢測(cè)

CircRNA常見問題——飛凡檢測(cè)

• 為什么CircRNA測(cè)序的研究比較熱？

  1）多角度闡述分子生物學(xué)問題的需要；

  2）從新的角度發(fā)現(xiàn)導(dǎo)致樣本存在差異的需要；

  3）尋找影響疾病發(fā)生的分子標(biāo)記；

  4）探究circRNA的未知功能；

  5）尋找導(dǎo)致microRNA表達(dá)發(fā)生變化的機(jī)理。

• CircRNA測(cè)序需要多少數(shù)據(jù)量？

  推薦10G clean data/樣本的數(shù)據(jù)量。

• CircRNA測(cè)序的條件？

  1. 有參考基因組，并且有CircRNA注釋信息；

  2. 有相應(yīng)的核糖體去除試劑盒。

• CircRNA有哪些特點(diǎn)？

  1. 大多存在于細(xì)胞質(zhì)中，且序列高度保守；

  2. 一般細(xì)胞或組織中，環(huán)狀RNA較穩(wěn)定，半衰期在48h，其他mRNA（線性）半衰期約為10h；血清中的外顯子環(huán)狀RNA不穩(wěn)定，半衰期<15s。

  3. 不同細(xì)胞中表達(dá)的環(huán)狀RNA可能不同；

  4. 同一個(gè)基因可能即產(chǎn)生線性mRNA，又可以轉(zhuǎn)錄成環(huán)狀RNA;

  5. 總量估計(jì)，外顯子環(huán)狀RNA（exonic ciRcRNA）的量約為polyA mRNA（線性mRNA）的1%；占非核糖體RNA的0.8%；

  6. 大部分為ncRNA。

飛凡檢測(cè)質(zhì)檢報(bào)告流程：

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  1、 提供產(chǎn)品資料

• 2、 工程師根據(jù)您的產(chǎn)品推薦合適檢測(cè)項(xiàng)目，并給出報(bào)價(jià)

• 3、 確認(rèn)報(bào)價(jià)沒有問題，然后把樣品送到我們實(shí)驗(yàn)室

• 4、 支付檢測(cè)費(fèi)用，安排檢測(cè)

• 5、檢測(cè)完成，出具檢測(cè)報(bào)告，郵寄給客戶

• 咨詢熱線：18018131362

• 關(guān)于飛凡

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飛凡檢測(cè)致力于打造國內(nèi)專業(yè)的第三方檢測(cè)服務(wù)公司，不斷優(yōu)化整合市場(chǎng)檢測(cè)資源，飛凡檢測(cè)與多家科研院所，如上海同濟(jì)大學(xué)，蘇州大學(xué)，SGS，TUV，以及國內(nèi)眾多知名的檢測(cè)公司進(jìn)行深度合作，共同為國內(nèi)制造業(yè)服務(wù)，為中國的制造業(yè)開拓海外市場(chǎng)保駕護(hù)航，為我們?nèi)粘Ｉ畹慕】蛋踩珮淞?biāo)桿；公司目前工程師百余人，95%以上是本科以上學(xué)歷；我們合作的實(shí)驗(yàn)室通過CNAS，CMA（EZ），所出具的任何一張報(bào)告都有CNAS，CMA資質(zhì)，確保出具的每份報(bào)告都具有權(quán)威的法律效力。

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• 為什么選擇我們

• 市場(chǎng)需求和成熟的模式給了我們成功的保證

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