宏基因組學(xué)（metagenomics）是一種以環(huán)境樣品中的微生物群體所有基因組作為研究對象，利用基因組學(xué)的研究策略研究環(huán)境樣品中所包含的全部微生物的遺傳組成及其群落功能的新的研究微生物多樣性的方法。
宏基因組學(xué)以微生物的多樣性、種群的結(jié)構(gòu)、進(jìn)化關(guān)系、功能活性、相互間的協(xié)作關(guān)系以及與環(huán)境之間的關(guān)系為研究目的，其研究方法有功能基因篩選及測序分析。運用的技術(shù)手段包括環(huán)境基因組整體測序及特征基因的擴增子序列。
優(yōu)點：
? 宏基因組不依賴于微生物的分離培養(yǎng)，克服了傳統(tǒng)的純培養(yǎng)方法的技術(shù)限制，為研究和開發(fā)利用占微生物種類99%以上的未可培養(yǎng)的微生物提供了一種新的途徑和良好的策略；
? 可以得到環(huán)境中豐度較低的，甚至是痕量微生物的信息，為研究低豐度微生物提供了途徑；
? 宏基因組學(xué)引入了宏觀生態(tài)的研究理念，對環(huán)境中微生物菌群的多樣性、功能活性等宏觀特征進(jìn)行研究，可以更準(zhǔn)確地反應(yīng)出微生物生存的真實狀態(tài)。
流程：
