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真菌多樣性分析ITS序列

瀏覽次數(shù):1281|來源:飛凡檢測 | 2021-11-16 13:54:18

ITS序列是內(nèi)源轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(Internally Transcribed Spacer),位于真菌18S、5.8S和28S rRNA基因之間,分別為ITS 1和ITS 2。 在真菌中,5.8S、18S和28S rRNA基因具有較高的保守性,而ITS由于承受較小的自然選擇壓力,在進(jìn)化過程中能夠容忍更多的變異,在絕大多數(shù)真核生物中表現(xiàn)出極為廣泛的序列多態(tài)性。同時,ITS的保守型表現(xiàn)為種內(nèi)相對一致,種間差異較明顯,能夠反映出種屬間,甚至菌株間的差異。并且ITS序列片段較?。↖TS 1和ITS 2長度分別為350 bp和400 bp),易于分析,目前已被廣泛用于真菌不同種屬的系統(tǒng)發(fā)育分析。 飛凡檢測進(jìn)行人體健康相關(guān)的研究與應(yīng)用

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真菌多樣性分析流程如下:


真菌多樣性分析流程


  • 高通量測序

目前市面上常用的用于研究環(huán)境微生物的高通量測序平臺有Illumina MiSeq,Roche 454和Ion Torrent PGM。針對于真菌ITS序列,MiSeq憑借其測序讀長長、測序周期短、通量大等特點,成為使用最為普遍的測序平臺。 飛凡檢測采用Illumina-MiSeq 2×300 bp平臺進(jìn)行微生物生態(tài)研究,其最大讀長可達(dá)到550 bp,能夠很好地覆蓋ITS 1和ITS 2序列,對其進(jìn)行測序分析。

物種組成圖 樣品群落結(jié)構(gòu)分析柱狀圖、多樣品對比樹圖、樣品群落結(jié)構(gòu)分析柱狀圖 微生物多樣性分析/宏基因組 LEfSe差異分析 PCA差異分析 RDA環(huán)境因子分析

飛凡檢測質(zhì)檢報告流程:


1、 提供產(chǎn)品資料

2、 工程師根據(jù)品資料的產(chǎn)品推薦合適檢測項目,并給出報價

3、 確認(rèn)報價沒有問題,然后把樣品送到我們實驗室

4、 支付檢測費用,安排檢測

5、檢測完成,出具檢測報告,郵寄給客戶

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關(guān)于飛凡


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飛凡檢測致力于打造國內(nèi)專業(yè)的第三方檢測服務(wù)公司,不斷優(yōu)化整合市場檢測資源,飛凡檢測與多家科研院所,如上海同濟(jì)大學(xué),蘇州大學(xué),SGS,TUV,以及國內(nèi)眾多知名的檢測公司進(jìn)行深度合作,共同為國內(nèi)制造業(yè)服務(wù),為中國的制造業(yè)開拓海外市場保駕護(hù)航,為我們?nèi)粘I畹慕】蛋踩珮淞?biāo)桿;公司目前工程師百余人,95%以上是本科以上學(xué)歷;我們合作的實驗室通過CNAS,CMA(EZ),所出具的任何一張報告都有CNAS,CMA資質(zhì),確保出具的每份報告都具有權(quán)威的法律效力。


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