全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序

全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序

基于PacBio三代測(cè)序平臺(tái)的全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，可直接獲取mRNA全長(zhǎng)序列，更為準(zhǔn)確地解讀mRNA結(jié)構(gòu)信息，重點(diǎn)關(guān)注基因的可變剪切、融合基因等。

測(cè)序應(yīng)用領(lǐng)域

◇ 獲得基因組未知物種的基因集，用于基因功能研究

◇ 基因結(jié)構(gòu)差異分析

◇ 發(fā)現(xiàn)新轉(zhuǎn)錄本

◇ 分子機(jī)制研究

◇ 基因表達(dá)調(diào)控研究

飛凡檢測(cè)測(cè)序的優(yōu)勢(shì)：

◇ 完善的樣品提取檢測(cè)方案，保障 mRNA 的完整性；

◇飛凡檢測(cè)擁有 PacBio Sequel 及 PacBio RSII 單分子測(cè)序平臺(tái)，提供測(cè)序服務(wù)；

◇ 深度測(cè)序推薦，挖掘低豐度基因信息；

◇ 分析團(tuán)隊(duì)，項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)豐富，提供個(gè)性化分析內(nèi)容。

技術(shù)路線：

飛凡檢測(cè)關(guān)于全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序常見(jiàn)問(wèn)題

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5. 1. PacBio測(cè)序平臺(tái)的技術(shù)原理？                                    

   利用 PacBio RS II/Sequel 進(jìn)行全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，平臺(tái)包含 16 個(gè)測(cè)序模塊（SMRT cell），每個(gè) SMRT cell 包含 15 萬(wàn)/100萬(wàn)個(gè)測(cè)序單元（零模波導(dǎo)孔，ZMWs）。需要將 mRNA 進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄并進(jìn)行環(huán)化處理，形成 CCS，每個(gè) ZMW（零模波導(dǎo)孔）將容納 1 個(gè) CCS 分子。由于全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序?qū)?mRNA 不進(jìn)行打斷，直接進(jìn)行上機(jī)測(cè)序，而每個(gè) CCS 的片段長(zhǎng)度不同，較小的 CCS 會(huì)先落入 ZMWs 中，而導(dǎo)致長(zhǎng)片段很難測(cè)到。因此，在文庫(kù)構(gòu)建時(shí)，需要將 mRNA 根據(jù)長(zhǎng)度分成不同的段，分別構(gòu)建文庫(kù)和測(cè)序。                                    

6.  2. PacBio測(cè)序平臺(tái)測(cè)序方案有什么推薦？                                    

   對(duì)樣本進(jìn)行分段處理，構(gòu)建不同片段長(zhǎng)度的文庫(kù)，我們推薦每個(gè)樣本構(gòu)建3-6個(gè)文庫(kù)。 建議8-15G subreads。                                    

7. 3. 全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析內(nèi)容包括哪些？                                    

   分析內(nèi)容包括：轉(zhuǎn)錄本覆蓋度計(jì)算、轉(zhuǎn)錄本功能注釋、轉(zhuǎn)錄本GO 分類(lèi)注釋、轉(zhuǎn)錄本 eggNOG分類(lèi)注釋、轉(zhuǎn)錄本KEGG分類(lèi)注釋、ORF分析、可變剪接分析等。   

飛凡檢測(cè)質(zhì)檢報(bào)告流程：

1、 提供產(chǎn)品資料

2、 工程師根據(jù)您的產(chǎn)品推薦合適檢測(cè)項(xiàng)目，并給出報(bào)價(jià)

3、 確認(rèn)報(bào)價(jià)沒(méi)有問(wèn)題，然后把樣品送到我們實(shí)驗(yàn)室

4、 支付檢測(cè)費(fèi)用，安排檢測(cè)

5、檢測(cè)完成，出具檢測(cè)報(bào)告，郵寄給客戶

咨詢熱線：18018131362

關(guān)于飛凡

飛凡檢測(cè)致力于打造國(guó)內(nèi)專(zhuān)業(yè)的第三方檢測(cè)服務(wù)公司，不斷優(yōu)化整合市場(chǎng)檢測(cè)資源，飛凡檢測(cè)與多家科研院所，如上海同濟(jì)大學(xué)，蘇州大學(xué)，SGS，TUV，以及國(guó)內(nèi)眾多知名的檢測(cè)公司進(jìn)行深度合作，共同為國(guó)內(nèi)制造業(yè)服務(wù)，為中國(guó)的制造業(yè)開(kāi)拓海外市場(chǎng)保駕護(hù)航，為我們?nèi)粘Ｉ畹慕】蛋踩珮?shù)立標(biāo)桿；公司目前工程師百余人，95%以上是本科以上學(xué)歷；我們合作的實(shí)驗(yàn)室通過(guò)CNAS，CMA（EZ），所出具的任何一張報(bào)告都有CNAS，CMA資質(zhì)，確保出具的每份報(bào)告都具有權(quán)威的法律效力。

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