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16S/18S/ITS擴(kuò)增子測(cè)序

瀏覽次數(shù):1172|來源:飛凡檢測(cè) | 2021-10-29 15:57:09

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原核微生物的16S rRNA基因長(zhǎng)度約為1500 bp,真核微生物18S rRNA基因長(zhǎng)度為1500 ~ 2000 bp,而ITS區(qū)長(zhǎng)度為400 ~ 900 bp。在以往的 研究中,16S/18S/ITS擴(kuò)增測(cè)序一般基于第二代高通量測(cè)序平臺(tái),讀長(zhǎng)較短,通常覆蓋16S V3、V4區(qū),18S V9區(qū),而微生物基因突變位點(diǎn)并不 是均勻分布的,基于單個(gè)可變區(qū)的測(cè)序分析有可能會(huì)高估或低估這些突變,進(jìn)而影響微生物群落的分類,因此二代擴(kuò)增子有可能會(huì)無法反映微 生物群落的真實(shí)情況。?

而PacBio三代測(cè)序可以獲得平均15 ~ 20 kb的長(zhǎng)讀長(zhǎng),在CCS測(cè)序模式下,可以實(shí)現(xiàn)擴(kuò)增子的多圈讀取,在獲得全長(zhǎng)擴(kuò)增子序列的同時(shí),保證 了序列的準(zhǔn)確性,能夠更加真實(shí)地反映微生物群落的組成情況。


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1、 提供產(chǎn)品資料

2、 工程師根據(jù)您的產(chǎn)品推薦合適檢測(cè)項(xiàng)目,并給出報(bào)價(jià)

3、 確認(rèn)報(bào)價(jià)沒有問題,然把樣品送到我們實(shí)驗(yàn)室

4、 支付檢測(cè)費(fèi)用,安排檢測(cè)

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